Cytoscape在生信数据挖掘的应用,我是汤达人,课程概述:
一、 课程简介
Cytoscape是一款开源和免费的,可进行图形可视化的强大软件,可快速构建各种关系网络图(例如:蛋白互作网络图、microRNA及相关基因的网络图),最终可得到发表SCI的图表。
本课程内容言简意骇,主要注重实际操作,旨在经过课程学习后可马上上手熟练操作,构建各种关系网络图。
此外,会提供本课程所有练习的文件,可供学员进行练习。购买本课程的学员可以加授课老师QQ:168094297,获得配套资料以及授课老师的及时答疑解惑。如有学员对本课程感兴趣,但存在疑问,也可加此QQ进行询问。
二、 课程目录
1.课程介绍
2.Cytoscape及相关插件的下载与安装
3.蛋白互作网络(PPI)及标注上下调基因
4.课程彩蛋:MicroRNA与基因网络的构建
5.GO富集分析—BiNGO与ClueGO插件的使用
6.Pathway富集分析—ClueGO插件的使用
7.筛选关键基因(Hub gene)—MCODE与CytoHubba插件的使用 适用人群:高校及研究所老师、临床医生及研究生、生物信息学研究人员、数据挖掘爱好者