WGCNA文章分析思路讲解,组学大讲堂,Omicsgene,生信小生,橙子红了没,omics007,因絮玄度,特别注意:
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课程通过讲解多篇WGCNA文献,帮助科员人员、学生等能快速掌握对应的分析逻辑,学会基于公共数据库数据开展类似的分析,挖掘自己研究邻域内的有效数据信息从而方便开展今后的实验。
文献讲解
1、基于WGCNA筛选过敏性哮喘相关biomarker
利用上呼吸道样品数据进行WGCNA分析筛选hub genes,并对筛选的结果进行ROC曲线验证。
2、基于WGCNA筛选宫颈癌相关预后因子
利用宫颈癌数据进行WGCNA分析筛选预后因子,并利用其他的公共数据及网站进行验证。
3、基于WGCNA分析乳腺癌相关的重要lncRNAs
根据WGCNA分析挖掘乳腺癌相关蛋白质编码基因和lncRNAs之间的网络,并筛选关键的lncRNAs进行验证。
4、基于WGCNA分析玉米株高相关基因互作网络
利用转录组测序数据进行WGCNA分,并结合差异基因,构建玉米株高相关基因的共表达网络
网站操作
1、基于UALCAN网站进行癌症相关基因表达数据获取已经生存曲线绘制。
2、利用KM-plotter网站对癌症基因进行生存曲线绘制。
3、利用Metascape进行基因注释富集分析。 适用人群:科研工作者
医学研究者
学生