扩增子分析-QIIME2与Kraken2,课程主要是基于扩增子原始下机序列到特征表、代表序列、物种丰度表、进化树等内容。核心内容为：1）使用fastp软件进行质控、结合vsearch软件处理、Kraken2和QIIME2分别注释物种；2）基于QIIME2使用DADA2处理原始序列得到特征表和代表序列，使用Kraken2和QIIME2分别注释；3）基于seqkit工具过滤掉未注释上物种的ASV及其对应的序列，基于QIIME2插件构建进化树和计算Alpha多样性；4）Kraken2、QIIME2物种注释数据库的构建，如Silva138、Unite8.3。 适用人群：适用于课题涉及扩增子测序的科研人员。需要对R语言、Linux基本命令有一定的基础。