单细胞转录组分析实操,组学大讲堂,Omicsgene,生信小生,中庸12,特别注意:
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课程介绍
本课程是针对10x Genomics平台的单细胞原始测序数据开始进行的实战课程,目的是为了让学员能够掌握单细胞转录组的分析原理,方法和实际操作。
主要内容包含:
单细胞转录组介绍:单细胞测序的发展、建库测序原理、分析内容;
前期准备:如何搭建单细胞生信分析环境、准备分析数据;
分析实操:详解分析流程、软件功能及参数设置。详解分析流程脚本及代码;实操分析步骤及代码使用,解读分析结果;
基础分析:测序数据比对基因组,表达定量;
标准分析:质控、降维聚类、细胞注释、差异/Marker基因分析等;
高级分析:发育轨迹、RNA速率、细胞通讯、CNV分析等。 适用人群:科研院所,大学,医学院学生等