Cytoscape与网络图绘制,组学大讲堂,Omicsgene,安生水,生信小生,因絮玄度,橙子红了没,omics007,特别注意:
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本课程介绍了Cytoscape在生物学领域的网络图绘制中的应用,有针对性利用实际案例(转录因子调控网络、ceRNA调控网络等主要的几个生物学领域的网络图)进行Cytoscape应用的教学讲解。
同时在多个案例中进行数据的解释和网络图绘制的引申,包括重点子网络的筛选等等。各章节实际侧重点不同,可以根据个人需求进行重点学习。简单的课下练习就可以非常好的掌握该软件的使用,并绘制出理想的网络图。
以下为课程的主要章节内容:
1、Cytoscapej基本介绍
课程大纲
Cytoscape下载安装
Cytoscape基本操作
2、Cytoscape绘制转录因子调控网络图
数据准备
网络图绘制
基于关键基因筛选子网络
3、Cytoscape绘制ceRNA调控网络图
数据准备
网络图绘制
基于作用类型筛选子网络
4、Cytoscape绘制蛋白质互作网络图
数据准备
网络图绘制
网络图merge 适用人群:高校、研究所老师、医生、学生,希望使用Cytoscape软件对生物学数据进行网络图的绘制