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医学癌症TCGA-基因差异表达分析,组学大讲堂,Omicsgene,安生水,橙子红了没,omics007,因絮玄度,特别注意: 1. 可开发票(请联系网易客服开票,或者加微信532812110咨询 ); 2. 购买课程满299元,可以加入我们的VIP技术交流群。 3. 本课程需要有R语言基础,没有R语言基础的同学请先学习我们的R语言课程《R语言基础与绘图(生物信息)》: https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1209073807&share=2&shareId=400000000234009 本课程针对TCGA的公开数据,讲解如何筛选癌症相关数据,并下载基因、lncRNA、miRNA的表达数据以及对应的病人的临床数据。基于下载的表达数据,比较癌症组织和正常组织之间的表达差异,针对表达差异的基因,通过蛋白互作(PPI)和GO, KEGG功能富集进行基因功能分析。 具体内容包括: 1. TCGA项目和数据介绍 2. GDC网站使用详解 3. 下载TCGA数据的3种方式 4. 如何使用R方便快捷的从GDC下载TCGA的数据 5. 如何从转录组数据中提取蛋白编码基因的表达量 6. 如何从转录组数据中提取lncRNA的表达量 7. 基因,lncRNA, miRNA 差异表达分析,聚类分析 8. 蛋白互作网络分析 9. GO, KEGG 功能富集分析 适用人群:1. 医生,临床科研工作者 2. TCGA癌症数据挖掘人员 3. 生信分析人员