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转录组测序(RNA-seq)数据分析,医学方,田赛赛,目前关于RNAseq的数据分析教程有很多,但是基于原始测序数据文件开始的数据分析流程相对较少,并且根据自己亲身实际,解读自己的测序数据就更少了。 本次的RNAseq数据分析教程主要是记忆原始测序数据fasta文件开始的全流程分析,当然主要是针对mRNAseq的数据分析,如果你是做的lncRNA或者miRNAseq亦或者cicroRNAseq本教程也会对你有一定的帮助。当然,可能在设置上也考虑到大部分课题组本身都是外包公司去测序,我们也带大家去解读测序公司给的数据,以及拿到数据如何自己分析。同时,我们增设了RNAseq分析中的一个难点问题,就是关于归一化方式的计算,让大家可以轻松实现TPM和FPKM的计算。 在该过程中,我尽量不浪费大家宝贵时间,只讲干货,手把手操作,liunx基础知识介绍→linux软件安装→数据质控/去接头→数据比对→数据定量→计算差异→火山图/热图绘制→公司数据解读→归一化详解→TPM/FPKM计算一气呵成。 在本次视频中,希望大家根据自己的需求学会RNAseq的数据分析。 适用人群:适合于所有医药类研究人员以及生物信息学者。
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