Gromacs基于生物体系模拟合集,天玑算-科研服务,授课方向 1、模型：蛋白，核酸，聚合物(均聚/共聚等) 2、性质计算：弱相互作用，结合能，伞形采样，牵引拉伸 3、结果分析： 1）动力学方向：均方根偏差(RMSD)，均方根涨落(RMSF)；溶剂可及表面积(SASA)，回旋半径(Rg)；氢键以及氢键寿命，径向分布函数(RDF)，空间分布函数(SDF)；相互作用能，结合自由能+能量分解，自由能垒(PMF) 2）量化方向：相互作用指示函数(IRI)，IGMH，ELF，LOL，ESP，HOMO/LUMO等 适用人群：初学者