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微生物OTU网络图绘制(Cytoscape),组学大讲堂,Omicsgene,omics007,生信小生,因絮玄度,橙子红了没,特别注意: 1. 可开发票(请联系网易客服开票,或者加微信532812110咨询 ); 2. 购买课程满99元,可以加入我们的VIP技术交流群。 课程主要内容为:利用软件Cytoscape以及多种分析方法对微生物测序数据中的OTU数据文件绘制网络图,涉及OTU和样品二分网络和OTU互作网络(共现性网络或相关性网络)。其中二分网络主要反映样品及其所属的OTU类别,同时反映OTU的相关权重等;而OTU互作网络主要是探究OTU之间的相互作用关系,揭示环境或其他样本中,不同OTU之间作用类型。 1、OTU与样品二分网络图(Cytoscape) 课程必读 介绍与数据 网络图绘:制操作与步骤 2、MENA:OTU互作网络分析(在线分析) 介绍与数据 MENA:操作过程(在线分析) MENA网络可视化(Cytoscape) 3、CoNet:OTU互作网络分析(Cytoscape) 介绍与数据 CoNet:操作步骤(上——网络分析) CoNet:操作步骤(下——网络可视化与聚类分析CytoCluster) 4、SparCC:OTU互作网络分析(Python) 介绍与数据 SparCC:操作步骤(linux运行命令) SparCC可视化与聚类分析(CoNet与CytoCluster) 适用人群:学生、科研人员、大学、微生物测序、OTU网络、Cytoscape