R语言在生物医学领域中的应用,赵坤0428,课程目录:
第一部分: R语言基本知识
R语言概述与软件下载安装
Rstudio软件使用说明
R语言程序包来源与下载方法简介
R语言常用数据结构解读
R语言基本数据管理方法简介
R语言高级数据管理方法简介
第二部分:R语言在统计分析中的应用
基本图形概述与应用原则
R语言基本图形绘制方法简介
描述性统计分析与统计图形
假设检验与R语言实现
方差分析与R语言实现
回归分析与R语言实现
第三部分:ggplot2在R语言绘图中的应用
ggplot2简介
ggplot2常用命令简介
ggplot2绘制统计图形方法简介
第四部分:R语言在生物信息学中的应用
差异基因分析-以DESeq2为例
基因富集分析-以clusterProfiler为例
RNA-Seq数据分析指南
单细胞RNA-Seq数据分析指南
第五部分:R语言在机器学习中的应用(暂定)
师资情况:
赵坤,男,浙江大学博士研究生,擅长meta分析与生物信息学方法学,目前已发表论文数十篇,以第一作者发表SCI论文1篇。创建科研创新服务平台微信公众号,关注人数近万人,致力于科研方法学的推广与应用。 适用人群:1.想要从事生物信息学专业的工作者
2.R语言初学者
3.感兴趣的研究生、本科生