空间转录组数据分析实操,组学大讲堂,Omicsgene,本课程linux部分的操作基于docker进行分析。
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课程介绍
本课程是针对10x Genomics平台的空间转录组原始测序数据开始进行的实战课程,目的是为了让学员能够掌握空间转录组的分析原理,方法和实际操作。
主要内容包含:
空转介绍:空转测序的发展、建库测序原理、分析内容;
前期准备:如何搭建空转生信分析环境、准备分析数据;
分析实操:详解分析流程、软件功能及参数设置。详解分析流程脚本及代码;实操分析步骤及代码使用,解读分析结果;
基础分析:测序数据比对基因组,表达定量;
标准分析:质控、降维聚类、spot注释、差异/Marker基因分析等;
高级分析:发育轨迹、RNA速率、细胞通讯、CNV分析等。 适用人群:需要对空间转录组数据进行数据分析的生物和医学科研人员,科研院所,大学,医学院学生等